メラトニンは、一般的に不眠症や時差ボケなどに利用されています。
不眠症に対する効果を検証した臨床試験が報告されていて、メラトニンが睡眠の質、睡眠導入、睡眠時間いずれの点についても改善することが示されています。
そのほか、抗酸化作用、抗ガン作用、胃粘膜保護作用、抗ストレス作用などにも効果を発揮することが期待されています。